Paso a paso para tramitar licencias médicas en Chile sin errores (afiliados a ISAPRE)

😷 Si estás afiliado a una ISAPRE y necesitas ausentarte del trabajo por razones de salud, es fundamental conocer cómo se tramitan las licencias médicas en Chile dentro del sistema privado. Aunque el proceso es similar al de FONASA, existen diferencias importantes en la revisión, fiscalización y pago de las licencias por parte de las ISAPREs.

En esta guía actualizada al 2025, te explicamos paso a paso cómo tramitar una licencia médica en una ISAPRE, qué documentos necesitas, cómo evitar errores comunes, y qué hacer si tu licencia es rechazada.

📌 ¿Qué es una licencia médica y cómo funciona en una ISAPRE?

Una licencia médica es un documento oficial emitido por un profesional de salud autorizado, que justifica la incapacidad temporal de un trabajador para ejercer sus funciones. En el sistema de ISAPRE, la licencia debe ser presentada y aprobada por el Departamento Médico de la ISAPRE, que evalúa si corresponde otorgar el subsidio por incapacidad laboral (SIL).

🔎 Dato relevante: Según cifras de la Superintendencia de Salud, en 2024 se tramitaron más de 5,4 millones de licencias médicas en ISAPREs, con un promedio de 7,5 días de reposo por licencia.

📝 Tipos de licencias médicas en Chile

Los motivos por los cuales un médico puede emitir una licencia médica son variados. A continuación, te explicamos los principales tipos reconocidos por la normativa chilena:

Enfermedad común: Se otorga cuando el trabajador sufre una enfermedad que le impide asistir a su trabajo por un tiempo determinado.

Accidente común o laboral: Se aplica si el trabajador sufre un accidente fuera o dentro del ámbito laboral. En el segundo caso, intervienen entidades como la mutual o ACHS.

Pre y postnatal: Las trabajadoras embarazadas tienen derecho a licencia por 6 semanas antes del parto y 12 semanas después del parto, prorrogables según la ley de postnatal parental.

Enfermedad grave del hijo menor de un año: Conocida como "licencia médica por hijo menor", permite a uno de los padres ausentarse para cuidar a su hijo enfermo.

Licencias psiquiátricas: Se otorgan por condiciones de salud mental diagnosticadas por un médico psiquiatra. Estas son revisadas con mayor rigurosidad por ISAPRES y COMPIN.

Cada tipo de licencia requiere distintos antecedentes clínicos y puede estar sujeta a plazos y fiscalizaciones específicas.

🧾 ¿Qué documentos necesitas para tramitar tu licencia médica?

Entregar la documentación completa y dentro de plazo es esencial para evitar rechazos:

Formulario de Licencia Médica (F.L.M.) llenado por el médico tratante

Informe médico o diagnóstico clínico, especialmente en licencias prolongadas o psiquiátricas

Cédula de identidad del afiliado

Certificado de cotizaciones previsionales (si eres trabajador dependiente)

En caso de embarazo, certificado de fecha probable de parto

🔔 Importante: Si eres afiliado a ISAPRE y trabajas de forma independiente, deberás acreditar ingresos mediante boletas o formulario 22 del SII.

🛠️ Paso a paso para tramitar una licencia médica en una ISAPRE

1. Consulta médica y emisión de la licencia 👩‍⚕️

Acude a un médico autorizado para emitir licencias. Este debe evaluar tu condición y, si corresponde, completar el formulario físico o digital.

2. Entrega de la licencia 📬

 Tienes 2 días hábiles desde la fecha de emisión para entregar la licencia médica a tu empleador (si eres dependiente) o directamente a tu ISAPRE (si eres independiente).

📥 El empleador debe remitirla a la ISAPRE en un plazo máximo de 3 días hábiles.

3. Evaluación de la ISAPRE 📋

La ISAPRE analizará tu licencia médica a través de su Departamento Médico, quien puede:

Aprobar la licencia y autorizar el subsidio

Modificarla (reducir días o cambiar el tipo de reposo)

Rechazarla, total o parcialmente

🧠 Dato: Según la Superintendencia de Salud, en 2024 el 22% de las licencias médicas presentadas a ISAPREs fueron rechazadas o modificadas por criterios médicos o administrativos.

4. Pago del subsidio 💰

Si la licencia es aprobada, la ISAPRE realiza el pago del subsidio directamente al afiliado. Este subsidio reemplaza tu remuneración imponible diaria y tiene un tope legal mensual establecido por ley.

🧑‍⚖️ ¿Qué hacer si la ISAPRE rechaza tu licencia médica?

Recibir un rechazo puede ser frustrante, pero tienes derecho a apelar. Estos son los pasos para reclamar:

Solicita la resolución formal de rechazo emitida por la ISAPRE.

Presenta una apelación ante el COMPIN dentro de los 15 días hábiles desde la notificación.

Adjunta todos los antecedentes clínicos actualizados, incluyendo exámenes, informes médicos y diagnóstico.

Escribe una carta de apelación explicando tu situación y por qué consideras injusto el rechazo.

🔎 Dato útil: En 2024, más del 35% de las licencias apeladas al COMPIN fueron revertidas a favor del afiliado, especialmente en casos de licencias psiquiátricas o por enfermedad grave.